afmformats

Submodules

• afmformats._version
  • Variables
    • __version__
    • __version_tuple__
    • version
    • version_tuple
    • __commit_id__
    • commit_id
• afmformats.afm_data
  • Classes
    • AFMData
      • AFMData.export_data()
      • AFMData.reset_data()
      • AFMData.columns
      • AFMData.columns_innate
      • AFMData.enum
      • AFMData.metadata
      • AFMData.modality
      • AFMData.path
  • Variables
    • column_dtypes
    • column_units
    • known_columns
• afmformats.afm_group
  • Classes
    • AFMGroup
      • AFMGroup.append()
      • AFMGroup.get_enum()
      • AFMGroup.subgroup_with_path()
• afmformats.afm_qmap
  • Functions
    • qmap_feature()
  • Classes
    • AFMQMap
      • AFMQMap.feat_core_data_height_base_point_um()
      • AFMQMap.feat_core_data_piezo_range_um()
      • AFMQMap.feat_core_data_scan_order()
      • AFMQMap.get_coords()
      • AFMQMap.get_qmap()
      • AFMQMap.extent
      • AFMQMap.features
      • AFMQMap.group
      • AFMQMap.shape
  • Variables
    • unit_scales
• afmformats.afm_segment
  • Classes
    • AFMSegment
      • AFMSegment.clear_cache()
      • AFMSegment.segment
      • AFMSegment.segment_indices
• afmformats.errors
  • Classes
    • AFMFileFormatError
    • DataFileBrokenError
    • FileFormatMetaDataError
    • FileFormatNotSupportedError
    • InvalidFileFormatError
    • MissingMetaDataError
      • MissingMetaDataError.meta_keys
• afmformats.formats
  • Submodules
    • afmformats.formats.fmt_chiaro_txt
      • Functions
        • load_txt()
    • afmformats.formats.fmt_hdf5
      • Functions
        • load_hdf5()
      • Classes
        • H5DictReader
    • afmformats.formats.fmt_igor
      • Functions
        • load_igor()
    • afmformats.formats.fmt_jpk
      • Submodules
        • afmformats.formats.fmt_jpk.jpk_data
          • Functions
            • find_column_dat()
            • load_dat_raw()
            • load_dat_unit()
          • Classes
            • ReadJPKError
          • Variables
            • JPK_COLUMNS
            • JPK_SLOTS
            • JPK_UNITS
        • afmformats.formats.fmt_jpk.jpk_meta
          • Variables
            • get_primary_meta_recipe
            • get_secondary_meta_recipe
        • afmformats.formats.fmt_jpk.jpk_reader
          • Classes
            • ArchiveCache
              • ArchiveCache.get()
            • JPKReader
              • JPKReader.get_data()
              • JPKReader.get_index_numbers()
              • JPKReader.get_index_path()
              • JPKReader.get_index_segment_numbers()
              • JPKReader.get_index_segment_path()
              • JPKReader.get_metadata()
              • JPKReader.set_metadata()
              • JPKReader.files
              • JPKReader.hierarchy
      • Functions
        • load_jpk()
    • afmformats.formats.fmt_ntmdt_txt
      • Functions
        • load_txt()
    • afmformats.formats.fmt_tab
      • Functions
        • load_tab()
    • afmformats.formats.fmt_workshop
      • Submodules
        • afmformats.formats.fmt_workshop.ws_map
          • Functions
            • load_map()
        • afmformats.formats.fmt_workshop.ws_single
          • Functions
            • load_csv()
  • Functions
    • find_data()
    • get_recipe()
    • load_data()
  • Classes
    • AFMFormatRecipe
      • AFMFormatRecipe.detect()
      • AFMFormatRecipe.get_modality()
      • AFMFormatRecipe.descr
      • AFMFormatRecipe.loader
      • AFMFormatRecipe.maker
      • AFMFormatRecipe.modalities
      • AFMFormatRecipe.suffix
  • Variables
    • default_data_classes_by_modality
    • formats_available
    • formats_by_suffix
    • formats_by_modality
    • supported_extensions
• afmformats.lazy_loader
  • Classes
    • LazyData
      • LazyData.set_lazy_loader()
• afmformats.logging_setup
  • Functions
    • configure_logging()
  • Variables
    • DEFAULT_LOG_PATH
• afmformats.meta
  • Functions
    • parse_time()
  • Classes
    • MetaDataMissingError
    • LazyMetaValue
    • MetaData
      • MetaData.as_dict()
      • MetaData.copy()
      • MetaData.get()
      • MetaData.get_summary()
      • MetaData.items()
      • MetaData.update()
      • MetaData.values()
  • Variables
    • IMAGING_MODALITIES
    • META_FIELDS
    • DEF_ALL
    • KEYS_VALID
• afmformats.mod_creep_compliance
  • Classes
    • AFMCreepCompliance
      • AFMCreepCompliance.appr
      • AFMCreepCompliance.intr
      • AFMCreepCompliance.modality
      • AFMCreepCompliance.retr
• afmformats.mod_force_distance
  • Classes
    • AFMForceDistance
      • AFMForceDistance.appr
      • AFMForceDistance.modality
      • AFMForceDistance.retr
• afmformats.mod_stress_relaxation
  • Classes
    • AFMStressRelaxation
      • AFMStressRelaxation.appr
      • AFMStressRelaxation.intr
      • AFMStressRelaxation.modality
      • AFMStressRelaxation.prep
      • AFMStressRelaxation.retr
• afmformats.parse_funcs
  • Functions
    • fbool()
    • fint()
    • vd_str_in()